MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	CCA	3	9	90	98	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835335
2	NC_012797	CCGC	2	8	123	130	0 %	0 %	25 %	75 %	239835335
3	NC_012797	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	239835335
4	NC_012797	GGC	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835335
5	NC_012797	CTG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835335
6	NC_012797	GCT	2	6	223	228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835335
7	NC_012797	CGACGG	2	12	229	240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	239835335
8	NC_012797	CGG	2	6	246	251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835335
9	NC_012797	CAT	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835335
10	NC_012797	TGC	2	6	294	299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835335
11	NC_012797	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835335
12	NC_012797	GCC	2	6	317	322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835335
13	NC_012797	CGC	2	6	341	346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835335
14	NC_012797	TGC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835335
15	NC_012797	CGAC	2	8	373	380	25 %	0 %	25 %	50 %	239835335
16	NC_012797	CGC	2	6	391	396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835335
17	NC_012797	GCCC	2	8	426	433	0 %	0 %	25 %	75 %	239835335
18	NC_012797	TCCA	2	8	449	456	25 %	25 %	0 %	50 %	239835335
19	NC_012797	CGG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835335
20	NC_012797	TCA	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835335
21	NC_012797	CCG	2	6	619	624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835335
22	NC_012797	CAG	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835335
23	NC_012797	ATC	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835335
24	NC_012797	GGC	2	6	874	879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835336
25	NC_012797	GCC	2	6	914	919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
26	NC_012797	CGC	2	6	952	957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
27	NC_012797	GTTT	2	8	1038	1045	0 %	75 %	25 %	0 %	239835336
28	NC_012797	AGT	2	6	1078	1083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835336
29	NC_012797	GCAG	2	8	1117	1124	25 %	0 %	50 %	25 %	239835336
30	NC_012797	CAGA	2	8	1139	1146	50 %	0 %	25 %	25 %	239835336
31	NC_012797	CA	3	6	1156	1161	50 %	0 %	0 %	50 %	239835336
32	NC_012797	CAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835336
33	NC_012797	CAG	2	6	1205	1210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835336
34	NC_012797	CAGA	2	8	1256	1263	50 %	0 %	25 %	25 %	239835336
35	NC_012797	CGC	2	6	1279	1284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
36	NC_012797	GCC	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
37	NC_012797	CCA	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835336
38	NC_012797	TGC	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835336
39	NC_012797	GC	3	6	1424	1429	0 %	0 %	50 %	50 %	239835336
40	NC_012797	CAT	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835336
41	NC_012797	TCG	2	6	1446	1451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835336
42	NC_012797	CCG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
43	NC_012797	GCCG	2	8	1484	1491	0 %	0 %	50 %	50 %	239835336
44	NC_012797	TACA	2	8	1565	1572	50 %	25 %	0 %	25 %	239835336
45	NC_012797	CAG	2	6	1577	1582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835336
46	NC_012797	CAG	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835336
47	NC_012797	AGAA	3	12	1669	1680	75 %	0 %	25 %	0 %	239835336
48	NC_012797	CCTG	2	8	1719	1726	0 %	25 %	25 %	50 %	239835336
49	NC_012797	ACG	2	6	1767	1772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835336
50	NC_012797	CCG	2	6	1794	1799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
51	NC_012797	ATC	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835336
52	NC_012797	GGCAG	2	10	1864	1873	20 %	0 %	60 %	20 %	239835336
53	NC_012797	TAT	2	6	1925	1930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239835336
54	NC_012797	CGC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835336
55	NC_012797	CCGG	2	8	1937	1944	0 %	0 %	50 %	50 %	239835336
56	NC_012797	GAG	2	6	1958	1963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835336
57	NC_012797	AG	3	6	2107	2112	50 %	0 %	50 %	0 %	239835336
58	NC_012797	GAA	2	6	2353	2358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835337
59	NC_012797	TTGTC	2	10	2361	2370	0 %	60 %	20 %	20 %	239835337
60	NC_012797	TTTA	2	8	2393	2400	25 %	75 %	0 %	0 %	239835337
61	NC_012797	TTC	2	6	2402	2407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835337
62	NC_012797	ACA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835337
63	NC_012797	ATT	2	6	2478	2483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239835337
64	NC_012797	AAG	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239835337
65	NC_012797	CAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835337
66	NC_012797	T	6	6	2622	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
67	NC_012797	T	8	8	2632	2639	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
68	NC_012797	CGT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835337
69	NC_012797	T	6	6	2755	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
70	NC_012797	CTATC	2	10	2776	2785	20 %	40 %	0 %	40 %	239835337
71	NC_012797	TTG	2	6	2853	2858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239835337
72	NC_012797	CAA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239835337
73	NC_012797	TGG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239835337
74	NC_012797	GGC	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835337
75	NC_012797	ATC	2	6	3017	3022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239835337
76	NC_012797	GGCG	2	8	3034	3041	0 %	0 %	75 %	25 %	239835337
77	NC_012797	CTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835337
78	NC_012797	CGACG	2	10	3064	3073	20 %	0 %	40 %	40 %	239835337
79	NC_012797	GTTT	2	8	3234	3241	0 %	75 %	25 %	0 %	239835337
80	NC_012797	GCC	2	6	3251	3256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835337
81	NC_012797	CGT	2	6	3337	3342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835337
82	NC_012797	GCC	3	9	3347	3355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835337
83	NC_012797	TGC	2	6	3378	3383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835337
84	NC_012797	GCC	3	9	3444	3452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835337
85	NC_012797	TTCT	2	8	3458	3465	0 %	75 %	0 %	25 %	239835337
86	NC_012797	CG	3	6	3569	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	239835337
87	NC_012797	CGC	2	6	3645	3650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835337
88	NC_012797	GCTTG	2	10	3655	3664	0 %	40 %	40 %	20 %	239835337
89	NC_012797	T	6	6	3700	3705	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
90	NC_012797	CTG	2	6	3797	3802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835337
91	NC_012797	ACG	3	9	3803	3811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835337
92	NC_012797	GATT	2	8	3836	3843	25 %	50 %	25 %	0 %	239835337
93	NC_012797	GGC	2	6	3911	3916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835338
94	NC_012797	CGTC	2	8	3927	3934	0 %	25 %	25 %	50 %	239835338
95	NC_012797	TTC	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835338
96	NC_012797	ACC	2	6	4017	4022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835338
97	NC_012797	GAC	2	6	4080	4085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835338
98	NC_012797	CGC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835338
99	NC_012797	CTTGC	2	10	4122	4131	0 %	40 %	20 %	40 %	239835338
100	NC_012797	CGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835338
101	NC_012797	TTTC	2	8	4169	4176	0 %	75 %	0 %	25 %	239835338
102	NC_012797	TTGT	2	8	4204	4211	0 %	75 %	25 %	0 %	239835338
103	NC_012797	CTG	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835338
104	NC_012797	TGC	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835338
105	NC_012797	GAG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239835338
106	NC_012797	CCA	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835339
107	NC_012797	CAC	2	6	4638	4643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835339
108	NC_012797	GCT	2	6	4842	4847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835339
109	NC_012797	CTT	2	6	4855	4860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835339
110	NC_012797	TTGGC	2	10	4910	4919	0 %	40 %	40 %	20 %	239835339
111	NC_012797	ATG	2	6	5048	5053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835339
112	NC_012797	CAC	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239835339
113	NC_012797	TTGGCC	2	12	5144	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835339
114	NC_012797	TGAT	2	8	5171	5178	25 %	50 %	25 %	0 %	239835339
115	NC_012797	CTT	2	6	5200	5205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835339
116	NC_012797	TCT	2	6	5214	5219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239835339
117	NC_012797	CTC	2	6	5221	5226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239835339
118	NC_012797	CCTGGG	2	12	5271	5282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239835339
119	NC_012797	CCCA	2	8	5401	5408	25 %	0 %	0 %	75 %	239835340
120	NC_012797	CTC	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239835340
121	NC_012797	GGAT	2	8	5494	5501	25 %	25 %	50 %	0 %	239835340
122	NC_012797	GCG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835340
123	NC_012797	GC	3	6	5594	5599	0 %	0 %	50 %	50 %	239835340
124	NC_012797	GA	3	6	5645	5650	50 %	0 %	50 %	0 %	239835340
125	NC_012797	GCA	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835341
126	NC_012797	GGC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835341
127	NC_012797	CGG	2	6	6023	6028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239835341
128	NC_012797	CGA	2	6	6085	6090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835341
129	NC_012797	CGC	2	6	6223	6228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239835341
130	NC_012797	ATG	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239835341
131	NC_012797	ACG	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835342
132	NC_012797	CAG	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835342
133	NC_012797	GCT	2	6	6432	6437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835342
134	NC_012797	GCT	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239835342
135	NC_012797	GAC	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239835343
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263	NC_012797	TG	3	6	13336	13341	0 %	50 %	50 %	0 %	239835350
264	NC_012797	T	7	7	13350	13356	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
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